پژوهش
مرکز بیوشیمی با آزمایشگاه های تخصصی مجهز و همچنین مشاوره های علمی، همواره مکانی مناسب برای محققین و علاقه مندان به تحقیقات بوده است. مهمترین فعالیت های پژوهشی مرکز عبارتند از:
 
  •  انجام پروژه های دانشجویان تحصیلات تکمیلی دانشکده مهندسی شیمی و نفت
  •  همکاری های پژوهشی و انجام پروژه های تحصیلات تکمیلی مشترک دانشکده های دیگر دانشگاه
  •  همکاری های مشترک با دانشگاه های دیگر
  • دوره های پسا دکتری و فرصت مطالعاتی
  • مشاوره های تخصصی
  • قراردادهای ارتباط با صنعت جهت حل مشکلات صنعتی کشور
محورهـای پژوهشـی عمدتاً به چند زمينه اصلي تقسـيم بندی شـده انـد که عبارتنـد از :
  • بیوتکنولوژی
  • نانوبیوتکنولوژی
  • مهندسی صنایع غذایی
  • مهندسی محیط زیست
  • مهندسی پزشکی
  • دارویی
  • میکروبیولوژی
  • سلول های بنیادی
پروژه های دانشجویی
تمرکز بر پروژه های تجربی در دوره های کارشناسی ارشد و دکتری و بعضاً کارشناسی، همواره مورد توجه اساتید و دانشجویان بوده است. دانشجو با انجام پروژه به صورت صد در صد آزمایشگاهی، علاوه بر مهارت های تکنیکی و کار با انواع دستگاه ها، توانایی حل مسئله و چالش های یک کار تحقیقاتی را از ابتدا آموزش می بیند و در آینده به عنوان یک فارغ التحصیل توانمند می تواند در عرصه های مختلف صنعت مثمرثمر باشد.
هر ساله حدود 50 دانشجوی کارشناسی ارشد و دکتری پروژه های تحقیقاتی خود را در آزمایشگاه های مرکز انجام می دهند.

قرار دادهای ارتباط باصنعت
با توجه به تخصص و دانش اعضای هیئت علمی دانشکده مهندسی شیمی و نفت و مرکز بیوشیمی به عنوان زیر مجموعه ی آن، و باتوجه به پتانسیل مرکز بیوشیمی جهت انجام تحقیقات، قراردادهایی با صنایع مختلف جهت حل مشکلات صنعت و ارائه راهکارهای کارآمد منعقد گشته است. این قراردادها با محوریت محیط زیست، بیوتکنولوژی، صنایع غذایی، مهندسی بافت، صنعت نفت، سلول های بنیادی و .... توسط اعضاء هیئت علمی وتیم همکار آنها و معاونت پژوهشی دانشگاه با موفقیت به پایان رسیده و یا درحال اجرا می باشند.

شتابدهنده زیست ران
با توجه به چشمگیر بودن سرمایه گذاری صنعت زیست فناوری جهانی در بخش تحقیق و توسعه که تا سال 2030 به عدد قابل توجه 21/1 تریلیون دلار خواهد رسید و به منظور نقش آفرینی هر چه بیشتر دانشگاه صنعتی شریف در برنامه جهش اقتصاد زیستی کشور، تفاهم نامه همکاری در راستای توسعه تحقیق و توسعه و تجاری سازی فناوری های حوزه زیست فناوری مابین مرکز تحقیقات مهندسی بیوشیمی و کنترل محیط زیست این دانشگاه و شتابدهنده زیست ران منعقد شد.
بر اساس این تفاهم نامه، تحقیقات بازار در حوزه زیست فناوری توسط شتابدهنده زیست ران شکل گرفته و پروژه های مختلف اقتصاد محور در حوزه های مهندسی سویه، مهندسی ژنتیک، تکنولوژی آنزیم و کاتالیت های زیستی، تکنولوژی جداسازی فرآورده های بیولوژیک، فرآورده های زیستی دریا، پروبیوتیک و مکمل های تخمیری طبیعی، کود و آفت کش های بیولوژیک، کنترل محیط زیست و باز استفاده از ضایعات، بیوتکنولوژی محاسباتی و تجهیزات حوزه سلامت و زیست فناوری با استفاده از پتانسیل منتورینگ اعضای هیات علمی دانشگاه صنعتی شریف،و در تعامل با بازیگران و فناوران اصلی این حوزه ها در کشور تعریف و اجرایی خواهد شد.همچنین تلاش می‌شود تا بوسیله شناسایی و ارتباط گیری موثر با گروه های زیست فناور و صندوق های خطر پذیر بین المللی چالش های مختلف علمی و مالی محققان داخلی را رفع کرده و رونقی به تحقیقات در حوزه زیست فناوی کشور داده شود، و به این شکل قدمی بنیادین برای تبدیل شدن دانشگاه صنعتی شریف به هاب توسعه زیست فناوری صنعتی کشور برداشته خواهد شد.
با توجه به وجود نیروی انسانی مستعد و زیرساخت مناسب در دانشگاه صنعتی شریف، این مرکز می‌تواند به عنوان پیش ران توسعه زیست فناوری صنعتی کشور در راستای نیل به اهداف اشاره شده در اسناد بالادستی مبنی بر کسب سه تا ده درصد سهم تولید ناخالص ملی از زیست فناوری باشد.